قم بثني سلسلة من البقايا عبر شبكة بحيث تتجمع الوحدات الكارهة للماء في نواة مدفونة، وتضغط الطاقة إلى الحد الأدنى المؤكد.
يتم تصميم البروتين على شكل سلسلة من البقايا الكارهة للماء (H) والقطبية (P) على شبكة ثنائية الأبعاد. الجيران الكارهون للماء الذين يجلسون متجاورين دون الارتباط بهم يقللون من الطاقة. هدفك هو طي السلسلة بحيث تشكل بقايا H نواة مدمجة وتحصل على الطاقة المثلى.
تم بناء Helixfold على النموذج الكلاسيكي للشبكة القطبية الكارهة للماء لطي البروتين، مما يحول البحث عن الطية إلى لغز.
سلسلة من البقايا الكارهة للماء والقطبية على شبكة، حيث تخفض التلامسات غير المترابطة بين H وH الطاقة، هي نموذج HP لـطي البروتين.
احتساب الطاقة مباشرة، بدلًا من التشابه مع شكل معروف، هو النهج الأصيل.
الطاقة هي الهدف الصحيح لأنها ما تقلّله الطبيعة. فـالتأثير الكاره للماء يدفع البقايا غير القطبية إلى الداخل، والنموذج الذي لا يكاد يحوي غير ذلك يعيد مع ذلك إنتاج اللب المتراص الذي تملكه البروتينات الحقيقية — ولهذا يبقى نموذج HP أداة للتعليم والبحث.
تم بناء Helixfold على النموذج الشبكي الكلاسيكي القطبي الكاره للماء لطي البروتين، مما يحول البحث عن الحد الأدنى من الطاقة إلى لغز ملموس. إنها لعبة متصفح أصلية ومجانية بثلاثة أطوال متسلسلة وأوضاع يومية بالإضافة إلى التدريب.